Mongodb 删除集合数据后如何释放磁盘空间

删除集合

在Mongodb当集合数据占用比较多，对其进行清理后，集合存储空间下降，但磁盘空间并没释放，对于具有活动更新的集合来说，有一些可重用的空间是正常的。过多的可重用空间通常是删除大量数据的结果。

如果您有许多大量集合需要压缩（或者想要尽可能的释放磁盘空间），请重新同步副本集的次要成员

如果compact最终没有释放足够的空间，通过初始同步将通过复制另一个成员的数据来重建所有数据文件。

compact 如果您确实决定在生产环境中运行，可以考虑将通过以下方式最大限度地减少影响：

副本集部署（理想情况下至少三个数据承载成员，没有仲裁者）
compact 一次在一台辅助设备上运行操作。
配置 secondary 为 hidden 在操作期间，竞争流量将是基本复制。
重新分配主节点。
压缩旧的主数据库。

集合数据如下：

local_rs1:PRIMARY> db.version()
4.4.15

# Primary 
local_rs1:PRIMARY> db.myCompact.count()
500000

local_rs1:PRIMARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
20520960

# 11747328 + 8773632 = 20520960
root@ubuntu-x64_01:/data/mongodb/data/test# ls -tl | grep 3518756157035530607 
-rw------- 1 mongodb mongodb 11747328 11月 17 10:53 collection-8--3518756157035530607.wt
-rw------- 1 mongodb mongodb  8773632 11月 17 10:53 index-9--3518756157035530607.wt

# -------------------------------------

# SECONDARY 1
local_rs1:SECONDARY> db.myCompact.count()
500000

local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
20492288

# 11661312 + 8830976 = 20492288
root@ubuntu-x64_01:/data/mongodb27018/data/test# ls -lt | grep 7679634562768091767
-rw------- 1 mongodb mongodb 11661312 11月 17 10:53 collection-8-7679634562768091767.wt
-rw------- 1 mongodb mongodb  8830976 11月 17 10:53 index-9-7679634562768091767.wt

# -------------------------------------

# SECONDARY 2 
local_rs1:SECONDARY> db.myCompact.count()
500000

local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
20533248

# 11702272 + 8830976 = 20533248
root@ubuntu-x64_01:/data/mongodb27019/data/test# ls -lt | grep 265063963681791421
-rw------- 1 mongodb mongodb 11702272 11月 17 10:53 collection-8-265063963681791421.wt
-rw------- 1 mongodb mongodb  8830976 11月 17 10:53 index-9-265063963681791421.wt

删除集合所有数据，执行 db.collection.deleteMany() 方法。 Compact 操作阻塞行为是特定于版本的。

compact 尝试减少集合中数据和索引所需的存储空间，向操作系统释放不需要的磁盘空间。此操作的有效性取决于工作负载，并且无法恢复任何磁盘空间。如果您已从集合中删除大量数据并且不打算替换它，则此命令非常有用。

测试删除 60% （300000/500000）集合数据，如下：

# PRIMARY 
local_rs1:PRIMARY> db.myCompact.find().limit(2)
{ "_id" : ObjectId("6556d1a2ff3d41b00910281b"), "uid" : 0, "username" : "compact0", "create_at" : ISODate("2023-11-17T02:36:18.883Z") }
{ "_id" : ObjectId("6556d1a2ff3d41b00910281c"), "uid" : 1, "username" : "compact1", "create_at" : ISODate("2023-11-17T02:36:18.894Z") }

local_rs1:PRIMARY> db.myCompact.deleteMany({ "uid" : { $lt: 300000 } })
{ "acknowledged" : true, "deletedCount" : 300000 }

local_rs1:PRIMARY> db.myCompact.count()
200000

以上清理数据后，磁盘空间和集合存储大小并没有减小。如下

# PRIMARY 
local_rs1:PRIMARY> db.myCompact.count()
200000

local_rs1:PRIMARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
28233728

root@ubuntu-x64_01:/data/mongodb/data/test# ls -tl | grep 3518756157035530607 
-rw------- 1 mongodb mongodb 15519744 11月 17 11:47 collection-8--3518756157035530607.wt
-rw------- 1 mongodb mongodb 12713984 11月 17 11:47 index-9--3518756157035530607.wt

# ----------------------------

# SECONDARY 1 
local_rs1:SECONDARY> db.myCompact.count()
200000

local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
30523392

root@ubuntu-x64_01:/data/mongodb27018/data/test# ls -lt | grep 7679634562768091767
-rw------- 1 mongodb mongodb 16674816 11月 17 13:09 collection-8-7679634562768091767.wt
-rw------- 1 mongodb mongodb 13848576 11月 17 13:09 index-9-7679634562768091767.wt


# ----------------------------

# SECONDARY 2
local_rs1:SECONDARY> db.myCompact.count()
200000

local_rs1:SECONDARY>  db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
20516864

root@ubuntu-x64_01:/data/mongodb27019/data/test# ls -tl | grep 265063963681791421
-rw------- 1 mongodb mongodb 11702272 11月 17 13:14 collection-8-265063963681791421.wt
-rw------- 1 mongodb mongodb  8814592 11月 17 13:14 index-9-265063963681791421.wt

Compact 集合

对于副本集，您可以在存储副本集中的集合和索引上使用 compact ，但是有一些重要的注意事项：

主节点不会将compact命令复制到辅助节点。
您应该尽可能在辅助节点上运行compact。如果您无法在辅助节点上运行compact，请使用 force 选项。
从 MongoDB 4.4.17 开始：
- compact 运行时辅助节点可以进行复制。
- 允许读取。

压缩辅助节点。compact 在辅助节点之一上运行。完成后 compact ，依次在剩余的每个辅助节点上重复该操作。

# SECONDARY 1 
local_rs1:SECONDARY> db.myCompact.count()
200000

local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
30523392

# 释放空间 23064576 = 22 MB 左右
local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { compact: "myCompact" } )
{
        "bytesFreed" : 23064576,
        "ok" : 1,
        "$clusterTime" : {
                "clusterTime" : Timestamp(1700198786, 1),
                "signature" : {
                        "hash" : BinData(0,"o2RnaYFH8J1pgLaIx2T+iLCkPdY="),
                        "keyId" : NumberLong("7236938018798436354")
                }
        },
        "operationTime" : Timestamp(1700198786, 1)
}

local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
7458816

# 4382720 + 3076096 = 7458816
root@ubuntu-x64_01:/data/mongodb27018/data/test# ls -lt | grep 7679634562768091767
-rw------- 1 mongodb mongodb  4382720 11月 17 13:26 collection-8-7679634562768091767.wt
-rw------- 1 mongodb mongodb  3076096 11月 17 13:26 index-9-7679634562768091767.wt

重新分配主节点。要让当前的初选下台并触发选举，请使用该 rs.stepDown()方法。要提名特定辅助节点，请调整成员优先级。

local_rs1:PRIMARY> rs.status()
{
        "set" : "local_rs1",
        "date" : ISODate("2023-11-17T05:41:07.931Z"),
        ........
        "members" : [
                {
                        "_id" : 1,
                        "name" : "192.168.88.11:27018",
                        "health" : 1,
                        "state" : 2,
                        "stateStr" : "SECONDARY",
                        ......
                },
                {
                        "_id" : 3,
                        "name" : "192.168.88.11:27017",
                        "health" : 1,
                        "state" : 1,
                        "stateStr" : "PRIMARY",
                        ......
                },
                {
                        "_id" : 4,
                        "name" : "192.168.88.11:27019",
                        "health" : 1,
                        "state" : 2,
                        "stateStr" : "SECONDARY",
                        ......
                }
        ],
        "ok" : 1,
        "$clusterTime" : {
                "clusterTime" : Timestamp(1700199666, 1),
                "signature" : {
                        "hash" : BinData(0,"a5utef8Cjsp20W8DWtvzsmMn9Wo="),
                        "keyId" : NumberLong("7236938018798436354")
                }
        },
        "operationTime" : Timestamp(1700199666, 1)
}


local_rs1:PRIMARY> rs.stepDown()
{
        "ok" : 1,
        "$clusterTime" : {
                "clusterTime" : Timestamp(1700199726, 1),
                "signature" : {
                        "hash" : BinData(0,"qpsh46gaM9GKg8RMV799tA/o8uw="),
                        "keyId" : NumberLong("7236938018798436354")
                }
        },
        "operationTime" : Timestamp(1700199726, 1)
}

压缩旧的主数据库。下台后，旧的主节点将成为辅助节点。compact 在旧主节点上运行。

local_rs1:SECONDARY> db.myCompact.count()
200000

local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
28233728

local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { compact: "myCompact" } )
{
        "bytesFreed" : 18976768,
        "ok" : 1,
        "$clusterTime" : {
                "clusterTime" : Timestamp(1700199986, 1),
                "signature" : {
                        "hash" : BinData(0,"D1zMSrcV9n2Deh/2u1Edw4s2pDk="),
                        "keyId" : NumberLong("7236938018798436354")
                }
        },
        "operationTime" : Timestamp(1700199986, 1)
}

local_rs1:SECONDARY> db.runCommand( { collStats: "myCompact" } ).totalSize
9256960

root@ubuntu-x64_01:/data/mongodb/data/test# ls -tl  | grep 3518756157035530607
-rw------- 1 mongodb mongodb  5341184 11月 17 13:46 collection-8--3518756157035530607.wt
-rw------- 1 mongodb mongodb  3915776 11月 17 13:46 index-9--3518756157035530607.wt

分片集群

对于分片集群，compact 仅适用于mongod实例。在分片环境中，运行 compact 分别在每个分片上作为维护操作。

注意：你不能针对一个mongos实例发出 compact

Ethanchen's notes